・BGMを動画の冒頭と末尾だけに設定することはできますか？

いいえ、PIP-Makerの仕様上、冒頭や末尾など特定のスライドのみにBGMを設定することはできません。
BGMは動画全体に対して適用される設定項目のため、スライドごとにBGMの再生・停止を切り替えたり、音量を個別変更したりすることはできません。  

【BGM機能の仕様・確認ポイント】
動画全体に適用：BGMは動画全体に対して一括で反映されます。  
スライド単位での制御不可：指定したスライドのみでBGMを流す設定や、スライドごとに音量を変更する設定には対応しておりません。