・動画を視聴した後に「視聴済みマーク」を表示することができますか？

はい、「プレイリスト機能」をご活用いただければ、
動画を最後まで視聴した際に「視聴済みマーク」を表示することができます。

詳細はプレイリストマニュアル【そのほかの設定や機能】をご参照ください。
▼マニュアル（プレイリストマニュアル）▼
https://info.pip-maker.com/manual/pdf/PIP-Maker_playlist.pdf